Voice Over

Jose Martín Rosete, Luiso Berdejo

Birbirinin aynısı olduğu iddiasıyla üç aşırı durumu anlatan İspanya yapımı Fransızca dilinde 10 dakikalık bir film. Bilim kurgu, savaş, aksiyon ve dram unsurları içeren ve yönetmenine En İyi Sinematografi ödülü kazandıran filmin IMDb puanı ise 7.3/10.

***

Reklamlar

All hail Sinatra!

Müzikleri kasetten dinlediğimiz dönemde yaşadığım rap müzik çılgınlığından caz müziğe öyle sert bir geçiş yapmıştım ki hayatımın bir dönemi hunharca Frank Sinatra olmuştu. Seslendirmiş olduğu şarkı sayısında dahi bir uzlaşma sağlanamamış olduğundan (1200 ile 1800 arasında) sonsuza dek Sinatra dinleme korkusuna kapıldığımda filmlerine geçmiştim.

Öncelikle Frank Sinatra ve Dean Martin’in on bin kere izlemiş olduğum bar videosunu buraya bırakayım.

Sinatra benim için nostaljik ya da eski değildi, keşfettiğim zaman tüm müzik türlerini bir kenara itip onu dinlemiştim. Sinatra benim için Dean Martin, Ella Fitzgerald, Sammy Davis Jr. gibi isimlere açılan kapı olmuştu aynı zamanda. Hal böyle olunca doğum gününü boş geçmek olmaz diye düşünerek bir kaç filmini (benim favorim olanları) paylaşmak istedim. Şarkılarını unutmaya fırsatımız yok ki hatırlayalım.

… ve evet, bugün Frank Sinatra’nın doğum günü.

 

Hemen izlemek isterseniz diye, tatmin edici bir kaynak: http://goo.gl/nOQMnM


 

 

 

HIBIT

Geçtiğimiz aylarda bir projemi bir konferansta poster olarak sergilemek/sunmak gibi bir iş edinmiştim. Bu macera sonunda bir kaç laf biriktirmiş oldum. Bunları not almıştım hemen yazılaştırmak adına ancak çarşambayı sel aldı, bir miktar geçikmiş oldu.

Lisans 3. sınıfta yani geçtiğimiz yıl ilk biyoinformatik projemi gerçekleştirdim. Mükemmel bir özetle, okuldaki bir hocamla ChIP-Seq sonuçlarında birden fazla yere haritalanan dizilerin geri kazanılmasına yönelik kafa yormuştuk. Proje dönem sonunda teslim edildikten sonra rafa kalkmıştı. Ta ki hocamın dikkat çekmesi ile HIBIT’ten haberdar olana dek. Sonrasında proje ile HIBIT’i bir posterde birleştirecektim. HIBIT yazısının devamı

Yapmanız gereken, anlayamayacağınız, unutulmaz, birbirinden iddialı…

Bu liste içerik olayını kim çıkardı, bir adım öne çıksın.

Korkarım çevrimiçi içerik üreticiliğinde yepyeni bir dönemdeyiz. Liste dönemi. Liste derleyici yazarların bir kısmının artık paragraflardan oluşan düz yazı yazma yeteneğini kaybetmiş olabileceğini bile düşünüyorum. Kimse gene de kişisel algılamasın.

Bir olayı, konuyu, olayları, konuları irdeleyen, inceleyen uzun ve “özgün” yazılar yazmanın zorluğu malum; hele de fotoğraflardan ve altlarındaki küçük paragraflardan oluşan listeler daha fazla talep görüyorsa. Düzenli liste üreticisi veya unutulmaz, muhteşem, en iyi yazarı iseniz bundan sonrası belki biraz gururunuza dokunabilir. Yoğun serzenişte bulunacağım.

Yapmanız gereken, anlayamayacağınız, unutulmaz, birbirinden iddialı… yazısının devamı

“Bir Biyoinformatik Kampından Sonra”

Biyoinformatik kampı geçtiğimiz hafta tamamlandı. Dünya’nın işini yaptık.

Anlatmaya nerden başlasam bilemiyorum. Biyoinformatik, lisans eğitimi bulunan ya da sertifikalandırılabilen bir alan değil. Bu durum aslında tek bir şeyi aşırı önemli ve değerli kılıyor, kişisel çaba. Özellikle ülkemizde biyoinformatikle ilgilenmek için kesinlikle bir kişisel ilgiye sahip olmak ve daha da önemlisi kendi yolunuzu kendiniz çizmek durumundasınız. Bu durumun zorluğu çokça çabalamanızın gerekmesi, avantajı ise ülke sınırları içerisinde henüz keşfedilmemiş pek çok yönde kendi yolunuzu açabilme imkanı. Biyoinformatik alanındaki kararlılığı sürdürebilmenin tek yolu bir şekilde sizi bu yolda ilerletecek bir şeyler bulmak. Bu nedenle Türkiye’de biyoinformatik adına atılan her adım geleceği doğrudan şekillendiriyor.

“Bir Biyoinformatik Kampından Sonra” yazısının devamı

D3’e Övgü

Veri analizinde en anlaşılır sonucu ortaya koyan tutumlardan biri görşelleştirmedir. Hatta karman çorman görünen veriler görselleştirme ile pek bi’ anlamlı görünür. Bugün biliyoruz ki görselleştirme için programlama dilleri ve yazılımlar gibi dijital araçlar kullanıyor.

Veri görselleştirme araçları arasında kullanım kolaylığı ve yenilikçiliği ile öne çıkan D3’ten biraz bahsetmek istiyorum. D3, web tarayıcısında özetle görselleştirme yapmak, etkileşimli grafikler oluşturmak için kullanılan bir JavaScript kütüphanesidir.

www.d3js.org 

HTML, CSS ve SVG tabanlıdır. Yani bu da demektir ki D3 kullanabilmek için en azından bu alt yapılara sahip olmak gerekiyor.

D3, öğrenmesi kolay ancak geliştirilmesi emek isteyen bir araç. D3 ile oldukça geniş bir yelpazede etkileşimli veri görüntüleme gerçekleştirebilirsiniz. Hemen biraz üstte vermiş olduğum adreste D3’ün maharetlerine hızlıca göz atabilirsiniz. Her bir örnek görselinin altında kaynak kodlarının verilmiş olduğunu görebilirsiniz; D3’ü kullanımı kolay yapan da bu doğrudanlığı aslında.

Kısacası D3, işi veri analizi ve veri görüntülemeye bir yerde düşen herkes için paha biçilemez bir kaynak.

D3 kullanabilmek için en azında HTML ve CSS bilmek gerektiğinden bahsetmiştim. Bunun için Codeacademy’de ilgili dersler size hemen yardımcı olabilir. Bu derslere de https://www.codecademy.com/en/tracks/web adresinden ulaşabilirsiniz.

Ek: Biyoloji alanında veri görselleştirme neye benzer diye aklınızdan geçiyorsa da http://ahmetrasit.com/blosum/ adresindeki uygulamaya göz atabilirsiniz.

 
 

Biyo Hackathon

Biyoinformatik kampında 48 saatlik bir kodlama maratonunu tamamladık. Biyo Hackathon adlı bu uygulamada yegane amacımız programlama yaparak biyoinformatik sorunlarına kendi çözümlerimizi getirmekti. Bu hackathon Türkiye’de alanında bir ilk oldu.

Hackathonlar bilgisayar programcılarının, yazılım, grafik veya donanım geliştiricilerin  genellikle yazılım projelerinde iş birliği yaptıkları 24 saat ile 1 hafta arasında süren etkinliklerdir. Biyoinformatik kampında yoğun şekilde ilgilendiğimiz Python programlama dilini kullanarak biyoinformatik alanında programlama deneyimlerimizi artırmak ve 48 saat boyunca tek bir amaca odaklanmak fikriyle bir hackathon düzenledik.

          Devamı: http://yazkampi2015.blogspot.com.tr/2015/07/bir-hackathon-gecti.html

Birkaç Konferans

Yaşam Bilimleri Biyoinformatik Eğitimi
ODTÜ Kimya Bölümü
16-18 Eylül 2015, http://www.biyoenformatikkursu.com/ 

The 2nd Middle East Molecular Biology Congress and Exhibition 2015
Istanbul Kongre Merkezi, 17-20 Eylül 2015, http://membs.org/membs/

Dokuzuncu Uluslararası Sağlık Bilişimleri ve Biyoinformatik Sempozyum (HiBiT)
Muğla Sıtkı Koçman Üniversitesi, Muğla, Turkey
16-17 Ekim 2015, http://hibit2015.mu.edu.tr/

 
 

Bir Kurs Geçti, Kamp Devam Ediyor

Ne zaman biyoinformatikle ilgili bir yazı yazacak olsam “İnsan Genom Projesi sonrasında…” ile başlayan cümleler kuruyorum. Bu durumdan o kadar soğudum ki artık biyoinformatiğin geçmişinden bahsetmenin başka yollarını arıyorum. Elimde şöyle bir bakış açısı var; insanoğlu olarak canlılığın anlamına doğru kazarken, açtığımız çukurda genetik bilgiyi elde ettik. Bunun olması bizi öyle heyecanlandırdı ki, canlılığa bakış açımız değişti. Artık elimizde bir kod vardı ve en basit haliyle bu kodu düzenlemek, canlılığı düzenlemek olacaktı. Bu noktadan sonra genetik mühendisliği ile ilgili alanların gelişimi durdurulamazdı.

Bir Kurs Geçti, Kamp Devam Ediyor yazısının devamı